自然人开店活动主要受到以下限制：
年交易额限制
自然人从事网络交易活动，年交易额累计不超过10万元的不需要进行登记。
经营活动限制
自然人从事经营活动需要依法取得经营资格，并进行工商等部门审批。
自然人必须依法进行登记，成为个体工商户，才能合法开展经营活动。
股东资格限制
限制民事行为能力人及无民事行为能力人不得作为发起人。
法律对特定职业的自然人从事营利性活动的禁止。
股份有限公司发起人受国籍或住所的限制。
登记要求
自然人如通过网络平台从事利用自己技能开展无须取得许可的便民劳务活动，或依托平台接受网约工作任务等，如需办理个体工商户登记，应使用电子商务平台提供的网络经营场所办理，并在其自然人住所所在地的市场监督管理部门进行登记。
综上所述，自然人开店活动主要受到年交易额、经营活动合法性、股东资格以及登记要求的限制。建议自然人在开店前，充分了解相关法律法规，确保经营活动合法合规，并进行必要的登记。
