小程序开发扣钱的方式主要涉及以下几个方面：
支付手续费
小程序官方默认的支付手续费是千分之六，即客人支付1000元，实际收到994元，这6元是手续费。这个费用是自动扣除的，不需要提前支付。
有些小程序开发公司作为微信支付接口服务商，可以申请到更低的支付费率，如千分之二，并提供给客户。
服务器费用
购买或租用服务器的费用根据小程序的注册会员数和日活数量而定，每年约一千到一万不等。量越大，服务器要求越高，价格也就越贵。建议选择独立服务器，便于后期升级配置。
HTTPS证书费用
为了保障交易及数据安全，需要购买HTTPS证书，费用每年在1000元以上，具体价格取决于安全级别要求。
功能开发费用
功能开发费用与需求、页面设计的多少有关。开发费用一般在2000-1万元之间，具体费用取决于功能的复杂度和开发公司的收费标准。
认证服务费
小程序认证需要支付300元/年，如果已有通过微信认证的公众号，可以通过公众号后台快速注册认证小程序，此项费用可以免除。
其他费用
包括域名注册、软件工具授权许可等第三方费用。域名年费在50~80元左右，服务器费用约2400~6000元/年，SSL证书费用约1000元/年。
建议
选择合适的开发方式：根据项目需求和预算，选择SaaS模板、成品源码或定制开发。SaaS模板适合需求固定且预算有限的情况；成品源码适合快速上线且预算有限的情况；定制开发适合有个性化需求且预算充足的情况。
考虑后期维护费用：除了开发费用外，还需考虑后期的维护和更新费用，包括服务器维护、SSL证书更新等。
比较不同服务商的费率：在选择支付接口服务商时，可以比较不同服务商的费率，选择最低的服务商以降低成本。
通过以上方式，可以更好地规划和管理小程序开发的费用。
