设置qPCR程序主要包括以下步骤:
选择合适的程序
根据引物和探针的特性选择合适的qPCR程序。常见的qPCR循环程序包括:
变性:95℃,10分钟
变性:95℃,15秒
退火:60℃,30秒
延伸:72℃,30秒
循环次数:通常设定为40次
设置荧光检测
在qPCR仪器中设置荧光检测参数,以便准确读取荧光信号
预变性阶段
预变性阶段,模板和反应体系的混合物在95℃孵育,使DNA解链的同时,激活热启动酶的活性。预变性时间与DNA聚合酶修饰有关,不同酶的qPCR预变性时间有较大差异。例如,抗体修饰酶如FP217仅需2分钟即可完全释放酶活,而化学修饰酶需要较长时间
循环阶段
循环阶段包括三个步骤:
变性:利用95℃高温将DNA解链成单链。
退火:引物与DNA模板结合,通常在55-65℃之间进行调整,通常在60℃可以获得理想效果
延伸:在适宜的温度下进行DNA合成,通常为72℃
设定反应程序
在qPCR仪上设定反应程序,包括预变性、循环和延伸等步骤的时间设置。例如,预变性2分钟,变性95℃ 15秒,退火60℃ 30秒,延伸72℃ 30秒,共40个循环
数据导出和分析
运行qPCR实验后,将数据导出到Excel等软件中进行分析,计算ΔCt值等指标
建议
选择合适的程序:根据具体的实验需求和试剂盒说明选择合适的qPCR程序,以确保实验的准确性和效率。
注意预变性时间:预变性时间对实验结果有重要影响,需根据使用的DNA聚合酶类型进行调整。
荧光检测设置:确保荧光检测参数设置正确,以便准确读取荧光信号。
数据导出与分析:实验结束后,及时导出数据并进行分析,以便得出可靠的实验结论。