当遇到办案程序违法的情况时，可以根据具体情况采取以下处理措施：
行政案件
对于程序轻微违法且对原告权利不产生实际影响的，根据《中华人民共和国行政诉讼法》第七十四条的规定，法院可以判决确认违法，但不撤销行政行为。
对于程序违法情况较严重的，法院可以判决撤销或者部分撤销行政行为，并要求被告重新作出具体行政行为。
刑事案件
如果公安机关在办案过程中存在程序违法，当事人可以向地方纪检、监察部门进行举报，由上级行政机关或者有关部门责令改正，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。严重者，可以移交检察院立案侦查，甚至追究刑事责任。
在刑事诉讼中，如果第一审人民法院的审理违反法律规定的诉讼程序，第二审人民法院应当裁定撤销原判，发回原审人民法院重新审判。
民事案件
对于违反法定程序的被诉具体行政行为，法院应当予以判决撤销。
民警违法办案
民警在办案过程中如果存在违法行为，除了接受行政处分外，还可能面临开除公职等更严重的处罚。当事人可以提出诉讼请求，或者由检察院提出公诉请求。
综上所述，针对办案程序违法的处理措施因案件性质不同而有所区别，但总体目标都是维护法律的公正和权威，保护当事人的合法权益。在实际操作中，建议根据具体案件情况选择合适的处理方式，并在必要时寻求专业法律人士的帮助。
