如果提拔程序存在瑕疵，可以采取以下整改措施：
加强干部选拔任用程序的规范化：
明确各环节操作要求，严格按照程序进行操作，确保每个环节都能够经过严格的审核和评估，防止随意通过等不规范行为的发生。
制定明确的选拔标准：
制定细致的选拔标准，明确各项指标的权重和评分标准，通过量化的方法来评估候选人的优劣。
推进信息公开透明：
明确干部选拔任用信息公开的要求，及时公布拟任职干部的履历和相关信息，接受社会公众的监督和评价。
加强权力制约和监督：
建立权力运行监督的机制，确保干部选拔任用工作的公正性和透明度。加强对干部选拔任用工作的内部监督，增强对干部选拔任用的风险防范和监控能力。
加强宣传教育：
通过多种形式宣传干部选拔任用工作的重要性和规范性，提高干部和群众的监督意识，加强对干部任用情况的了解和监督。
完善整治用人不正之风的监督机制：
加强对干部选拔任用各环节的监督，建立健全整治用人不正之风的监督机制，对违规行为进行严肃处理，确保选拔任用工作的公正性。
严格执行干部选拔任用工作规定：
包括严格执行干部任用纪律，形成科学的选人用人机制，遏制用人上的不正之风；严格执行干部选拔任用程序，坚决把好程序关，规范干部选拔任用方式和程序；严格执行干部监督工作责任制，对监督检查不力的责任主体实施相应制约措施。
建立用人质量评估体系：
在对《干部任用条例》执行情况进行定期检查的基础上，对用人情况作综合评估，并作为领导干部特别是一把手个人提拔任用的重要依据。
建立干部推荐、考察、讨论决定责任制和用人失察失误责任追究制度：
明确干部推荐、考察、决策各个环节的责任主体和会组工。
通过以上措施，可以有效解决提拔程序中存在的瑕疵，确保干部选拔任用工作的公正性、透明性和科学性。
