如果再审程序存在违规情况，当事人可以采取以下步骤进行处理：
向人民法院申诉
提交材料：申诉人应准备申诉状，说明申诉的事实与理由，并提供原一、二审判决书、裁定书等法律文书。如果案件已经经过人民法院复查或再审，还应附上驳回通知书、再审决定书、再审判决书、裁定书等相关文件。
向人民检察院申诉
申请抗诉：当事人及其法定代理人、近亲属对已经发生法律效力的判决、裁定，可以向人民检察院提出申诉。人民检察院有权对申诉材料进行审查，并在认为判决、裁定存在错误时，向人民法院提出抗诉。
上诉
一审判决未生效：如果一审判决尚未生效，当事人可以在上诉期内（民事案件为15天，刑事案件为10天）向上一级法院提起上诉，由上级法院重新审理和判决。
判决已生效：如果判决已经生效，当事人可以向原审人民法院或上一级人民法院申请再审，或者向检察院申请抗诉。
注意时效
上诉时效：民事案件的上诉期为判决书送达之日起15日内，刑事案件为10日内。
申请再审时效：当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以自判决、裁定发生法律效力之日起六个月内向上一级人民法院提出再审申请。
遵循法定程序
书面材料：在申请再审的过程中，当事人应按照程序要求撰写并提交正式有效的再审申请书面材料，包括再审申请书和正式的法律涵摄论证。
通过以上步骤，当事人可以依法维护自己的合法权益，纠正可能存在的再审程序违规情况。建议在申诉过程中，咨询专业律师以获取更详细的法律帮助。
