针对多处程序违法的处罚问题，以下是一些关键的处理措施：
责令改正与行政处分
如果行政处罚过程中存在程序违法，有权机关应当依照规定的程序实施处罚。如果不遵守法定程序，行政处罚将被视为无效。
在作出行政处罚决定之前，不依法向当事人告知给予行政处罚的事实、理由和依据，或者拒绝听取当事人的陈述、申辩，行政处罚决定也不能成立。
如果实施行政处罚的过程中违反法定的行政处罚程序，由上级行政机关或者有关部门责令改正，并且可以对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。
重新作出处罚决定
经法院审理确认违法行为后，行政机构将依法定程序重新作出处罚决定。行政处罚程序是国家行政机关遵循法律规定，对违反行政法规但尚未构成犯罪的当事人采取相应制裁措施的合法流程和步骤。
备案与审查
执法人员当场作出行政处罚决定的，应当向当事人出示执法身份证件，填写预定格式、编有号码的行政处罚决定书，并当场交付当事人。该行政处罚决定书应当报所属行政机关备案。
法院撤销或部分撤销
在法律框架内，中国法院有权撤销或部分撤销违反法定程序的行政处罚，并可能要求相关部门重新作出处理决定。对于类似情况的再次发生，相关方面无权使用相同的事实和理由作出相似行为。
合并执行处罚
如果同一个违法行为触犯多个行政法律法规，行政机关可以分别作出处罚，然后合并执行。合并执行可以制作一份决定书，分别写明对每种违法行为的处理内容和合并执行的内容。
建议
加强程序合法性：行政机关在实施行政处罚时，必须严格遵守法定程序，确保每一个步骤都合法合规，避免因程序违法而导致行政处罚无效或被撤销。
保障当事人权益：在作出行政处罚决定前，应充分告知当事人事实、理由和依据，并听取其陈述和申辩，保障当事人的合法权益。
完善监督机制：加强对行政处罚过程的监督，确保行政机关依法履行职责，防止程序违法行为的发生。
通过以上措施，可以有效应对和处理多处程序违法的处罚问题，确保行政处罚的公正性和合法性。
