如果发现法院在审理案件时未进行质证程序，违反了《民事诉讼法》及相关司法解释，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
提出异议：
首先，您可以向审理案件的法官提出异议，要求对未质证的证据进行质证。根据法律规定，所有证据都应当经过质证才能作为认定案件事实的依据。
上诉：
如果法官未采纳您的异议，您有权向上级法院提起上诉。在上诉过程中，您可以明确指出法院未进行质证程序违法，并提供相关证据支持您的主张。
向监察部门反映：
您还可以向法院的监察部门或上级法院的检查委员会反映情况，要求对法官的审判行为进行审查，并请求重审案件。
申请再审：
如果上诉后法院仍未纠正程序违法问题，您可以根据《民事诉讼法》的相关规定，申请再审。
寻求法律援助：
在采取上述措施的过程中，您可以寻求专业律师的帮助，律师可以为您提供法律咨询和代理服务，帮助您更有效地维护自己的合法权益。
根据《民事诉讼法》及相关司法解释，未经质证的证据不能作为认定案件事实的依据。因此，您有权利要求法院依法进行质证，并确保自己的诉讼权利不受侵犯。
建议：在诉讼过程中，您应当密切关注案件的进展，及时发现问题并采取相应措施，以保障自己的合法权益。同时，保持与律师的沟通，以便获得更专业的法律支持。
