当程序缺失时，党纪处分的处理需要遵循以下步骤：
初步调查与核对事实
对违犯党的纪律的党员所犯的错误事实进行认真核对调查，写出调查报告，并同党员本人进行谈话，听取他对错误事实的说明和申辩。
形成决议
除特殊情况可由县级和县级以上各级党委和纪律检查委员会直接做出处理决定外，一般都必须经过党员大会讨论决定，并按照处分党员的批准权限的规定，逐级报上级党组织批准。
通知与申辩
党员大会讨论对党员的处分时，应通知受处分的党员出席会议。允许本人申辩，也允许别人替他辩护。
签署意见
党员大会通过处分决定后，应将处分决定和所依据的事实材料同本人见面，并让他在处分决定上签署意见，然后上报。
上级党组织批准
给予撤销党内职务以上的处分以及本人对处分有意见的，批准处分的党组织在审理过程中，应派人或委托下级纪委同受处分人谈话，听取本人对所认定的错误事实与定性处理的意见，同时对他进行必要的教育。
集体讨论决定
上级党组织批准对党员的处分决定，必须经集体讨论决定。决定后应正式下达批复。
宣布与通知
处分决定下达后，下级党组织应在适当范围内宣布，并通知犯错误的党员。
建议
确保程序合规：在处理党纪处分时，必须严格按照党章和相关规定执行，确保每一个步骤都有明确的法律依据和程序保障。
保障申辩权利：在处分过程中，应充分保障党员的申辩权利，确保其能够充分表达自己的意见和看法。
加强监督与问责：对于程序缺失或违规操作的情况，应加强监督和问责，确保党纪处分的公正性和严肃性。
通过以上步骤，可以确保在程序缺失的情况下，党纪处分仍然能够依法、公正、严肃地进行。
