要让程序不在顶层执行，即让程序在后台运行而不显示在任务栏或开始菜单中，可以采取以下几种方法：
使用注册表编辑器
打开注册表编辑器（`regedit`）。
导航到 `HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run`。
在右侧窗口中，创建一个新的字符串值，将其命名为你想要自动启动的程序名称，并将程序的完整路径作为值。这样，程序将在系统启动时自动运行，并且不会在任务管理器中显示。
使用脚本或批处理文件
创建一个批处理文件（`.bat`）或VBScript文件，并在其中编写启动程序的命令。
例如，使用批处理文件启动程序：
```batch
start /b "C:\path\to\your\program.exe"
```
使用VBScript文件启动程序：
```vbscript
Set WShell = CreateObject("WScript.Shell")
WShell.Run "C:\path\to\your\program.exe", 0
Set WShell = Nothing
```
保存文件后，通过双击该文件或在命令行中运行它来启动程序。使用 `/b` 参数可以在后台启动程序，不会显示在任务栏中。
使用系统服务
将程序设置为系统服务，这样它将在系统启动时自动运行，并且可以在任务管理器中隐藏。
可以使用第三方工具如 `NSSM`（Non-Sucking Service Manager）或 `SC` 命令来创建和管理系统服务。
使用远程桌面
通过远程桌面连接到自己的计算机，在远程桌面会话中启动程序。这样，程序将在远程会话中运行，而不是在本地计算机的顶层运行。
使用第三方软件
有些第三方软件允许你隐藏程序的窗口，使其在后台运行。例如，可以使用 `AutoHotkey` 或 `PowerShell` 脚本来实现这一功能。
请注意，修改注册表或创建系统服务可能会对系统稳定性产生影响，因此在进行这些操作之前，请确保备份重要数据，并了解相关风险。
