签署店铺协议时，签字的位置和方式应遵循以下原则：
签字主体
个人租赁商铺：应由年满18周岁且精神正常的承租人本人签字。如果承租人委托他人代签，则需要提供合法有效的授权委托书，并且被委托人需持委托书及自身身份证明签字。
法人或其他组织租赁商铺：应由法定代表人签字，或者由持有法定代表人签字盖章的授权委托书的代理人签字，并在签字处加盖公司的公章或者合同专用章。
签字位置
签字通常位于合同的结尾处专门的签字栏。在多页合同的情况下，除了在最后一页签字外，建议在每一页的下方也签字或者加盖骑缝章，以防止合同内容被替换或篡改。
签字形式
尽量使用黑色或蓝色的钢笔或签字笔签字，避免使用铅笔或者容易褪色的笔。签字应清晰可辨，不能潦草到无法识别。
签字地点
签字地点可以由合同双方协商确定。常见的签字地点包括租赁店铺内、双方都方便的第三方场所（如律师事务所、公证处等）、出租方的办公场所、承租方的办公场所，或者双方约定的其他地点。
其他注意事项
在签字时，建议注明签字日期，以便明确合同的签署时间顺序等相关法律意义。
如果合同采用电子形式，签署方式应符合电子合同相关法律法规的要求，如使用数字证书签名等。
综上所述，签署店铺协议时，签字应在合同规定的签字栏进行，且需确保签字主体合法、签字形式规范、签字地点明确。如果合同有多页，建议在每一页下方签字或加盖骑缝章。此外，根据具体情况，可以选择在租赁店铺内、第三方场所、出租方或承租方的办公场所，或者双方约定的其他地点进行签字。
