店铺噪音扰民的管理涉及多个部门，具体如下：
环保部门
负责对商业经营产生的噪声进行管理和查处，居民可以向当地环保部门投诉，拨打12369电话进行投诉。
城市管理部门
负责对涉及城市生活噪声的管理，例如室内装修、广场高音喇叭、叫卖等噪音，由城市管理部门为主进行管理。
公安部门
负责对涉及社会生活噪声的扰民行为进行管理，例如涉及空调、餐饮店等产生的噪音，居民可以向当地派出所投诉，由公安机关进行处理和处罚。
工商部门
可以接受对店铺营业合法性、是否取得相关证件和审批手续的投诉，并进行检查。
基层群众性自治组织、业主委员会、物业服务人
应当及时劝阻、调解噪声扰民行为，劝阻无效的，可以向负有噪声污染防治监督管理职责的部门或地方人民政府指定的部门报告或投诉。
综上所述，针对店铺噪音扰民问题，居民可以根据噪音的具体类型选择向环保部门、城市管理部门、公安部门或工商部门进行投诉。同时，涉及邻里纠纷的，还可以通过物业或业主委员会出面协调解决。
