开店最怕查的主要包括以下几个方面：
城管部门：
特别是开饭馆的商家，城管部门可能会随时进行检查，轻则罚款，重则停业整顿。此外，商贩在门前三包处摆放物品，影响行人行走和环境卫生，也会被城管部门查处。
工商部门：
包括市场监管局、工商税务部等，主要检查店铺是否合法经营，有无取得合法经营执照，是否存在违规行为等。如果发现无照经营或违规经营，可能会面临罚款、停业整顿等处罚。
卫生部门：
对食品安全和卫生要求非常严格，如果被查出违规行为或卫生问题，可能会导致店铺被封闭、罚款甚至关闭。卫生问题也会影响顾客对店铺的信任度和口碑，对生意造成负面影响。
消防部门：
检查店铺是否存在消防安全隐患，如果不符合消防安全规定，可能会面临处罚和整改。
环保部门：
检查店铺是否遵守环保法规，是否存在环境污染问题，如噪音、废水排放等。
税务部门：
个体户最怕查的是税务问题和财务不合规，如逃税或偷漏税行为，可能会面临严重的罚款和法律责任。同时，不合规的记账和虚假财务报表等行为也会引起监管部门的关注和惩罚。
交通运输管理处和消费者协会：
开汽修店最怕被举报交通运输管理处，而消费者协会则属于被动监督，但消费者可以通过该协会寻求帮助，如提供备用车辆等。
食品药品监督局：
对餐饮行业的食品安全问题进行查办，如未取得合法经营执照或存在食品安全问题，可能会被要求停业整顿或罚款。
综上所述，开店最怕查的是那些与合法经营、卫生安全、消防安全、环保法规、税务合规等相关的方面。为了避免不必要的麻烦和损失，商家应严格遵守相关法律法规，保持店铺的清洁和食品的安全，确保所有经营行为合法合规。
