店铺单位不让开店的原因可能有以下几点：
地方保护主义：
有些地方政府职能部门规定，一些销售企业只能经营本地产品，招待用餐也只能喝本地酒，排除、限制外地区企业到本地投标，严重妨碍商品在地区之间的自由流通。这种行为违反了《反垄断法》。
单位规定：
如果朋友的事业单位不允许他从事经商活动，那么他开店可能会违反单位的规定，甚至可能会受到纪律处分。此外，如果你帮他注册营业执照，可能会被认为是参与了经商活动，也可能会受到相应的处罚。
利益冲突：
事业单位人员若从事商业活动，可能会利用手中的职务之便进行不正当交易，从而产生利益冲突。
防止腐败：
禁止事业单位人员经商可以有效防止腐败现象的发生，确保公职人员能够专注于公共服务。
遵守法律法规：
根据《事业单位工作人员处分暂行规定》等相关法律法规，事业单位人员从事营利性活动是违法的，并会受到相应的处分。
维护公共形象：
事业单位人员从事商业活动可能会影响其公共形象，因此单位可能不允许其开店以维护形象。
综上所述，店铺单位不让开店的原因可能涉及地方保护主义、单位规定、利益冲突、防止腐败、遵守法律法规以及维护公共形象等多个方面。建议在考虑开店时，务必了解并遵守相关法律法规，避免违反单位规定和法律法规。
