创业板注册制下，企业虽然可以获得更多的融资机会和更高的市场认可度，但同时也面临着一系列的风险和挑战。以下是一些可能的后遗症：
市场波动性加剧：
由于创业板上市门槛相对较低，上市数量增多，市场供给增加，这可能会加剧市场的波动性。特别是新上市企业在前五个交易日没有涨跌幅限制，从第六个交易日开始实施20%的涨跌幅限制，较主板市场的10%涨跌幅限制更为宽松，这使得创业板股票的价格波动幅度可能更大，投资者需要更高的风险承受能力。
投资者保护问题：
在注册制下，监管部门主要关注企业的信息披露质量，而不再对企业的盈利能力、发展前景等进行实质性审核。这意味着，市场上可能会出现一些业绩不佳、风险较高的企业上市。对于普通投资者而言，缺乏专业的投资知识和经验，难以准确判断企业的投资价值，容易陷入投资陷阱，导致资金损失。
退市风险增加：
创业板注册制的退市制度更加严格，对于违规或业绩不达标的企业，将直接退市，没有退市整理期。这在一定程度上提高了市场的优胜劣汰效率，但同时也增加了投资者的退市风险。一旦投资者持有的股票被退市，将面临巨大的资金损失。
财务信息真实性难以保障：
创业板企业通常处于创业阶段，尚未形成稳定的盈利模式，财务信息的真实性难以保障。此外，某些创业公司将财务数据处理得十分复杂，使外界难以获得准确的财务信息。这不仅使得投资者难以评估所投项目的风险，也使得创业板的监管难度加大。
转板违规行为增多：
随着创业板企业市场表现出色，越来越多的企业试图通过转板来获取更多的资金。然而，一些创业板企业存在夸大过度、虚构业绩和隐瞒重要信息等违规行为。此外，一些企业为了能够顺利转板，擅自更改注册资本、持股结构等信息，导致股权转让、投资者利益受损。
投资者风险意识不足：
随着创业板注册制的推进，投资者对创业板企业的关注度和投资热度不断升高，很多未经过专业培训和游戏规则培养的投资者盲目跟风、盲目追涨。一旦市场波动，他们容易担惊受怕、追高期待和恐慌游离。此外，由于创业板企业市场流动性较弱、价格波动较大，投资者的风险敞口很难得到有效控制，非合理风险导致投资者受损。
股票摘牌风险：
创业板市场的股票被摘牌的概率大于主板市场，因为创业板股票的特点是上市公司规模较小，且处于创业阶段。
上市公司的经营风险：
创业板企业的经营稳定性整体上低于主板上市公司，一些上市公司经营可能大起大落甚至经营失败，上市公司因此退市的风险较大。
上市公司诚信风险：
创业板公司多为民营企业，可能存在更加突出的信息不对称问题，完善公司治理、加强市场诚信建设的任务更为艰巨。如果大面积出现上市公司诚信问题，不仅会使投资面临巨大风险，也会使整个创业板发展遇到诚信危机。
综上所述，创业板注册制虽然带来了诸多机遇，但同时也伴随着一系列风险问题。投资者在参与创业板交易时，应充分了解相关风险，评估自身的风险承受能力，并寻求专业的投资建议。
