小程序赚钱扣税问题主要涉及以下几个方面：
资金流向与税务责任
如果小程序工作室仅作为中介，代收客户款项再转给甲方，且没有从中获取额外收入，可能无需缴税，但需确保资金流向清晰、符合相关法律法规。
若工作室从中获取了服务费或其他收入，则需按税务规定缴纳相应的增值税和个人所得税。
开具发票
通常情况下，工作室不需要给甲方开具发票，甲方提现时应该由甲方开具发票给工作室（中间商）。
如果甲方是个人，可以不开票，但个人提现可能涉及代扣代缴个税的问题。
税率与缴税
微信小程序入驻商家混合销售额的增值税率为6%，应遵照《增值税暂行条例》、《个人所得税法》及相关法规的规定，依法申报缴纳增值税和所得税。
个人经营所得的税率范围为5%-35%，商城平台可以为分销员缴纳个税，通过第三方服务方代发佣金可以解决成本进项抵扣和个人完税问题。
合规与代扣代缴
确保所有交易和资金流向符合相关法律法规，避免逃税漏税。
如果甲方是个人，提现时可能需要代扣代缴个人所得税，建议咨询专业的税务顾问或使用合规的税务服务方来处理此类问题。
建议
明确税务责任：首先明确小程序工作室在交易中的角色和收入来源，确定是否需要缴纳增值税和个人所得税。
合规开具发票：根据交易情况，合规开具发票，避免因发票问题引发税务风险。
咨询专业税务顾问：对于复杂的税务问题，建议咨询专业的税务顾问或使用合规的税务服务方，确保税务处理的准确性和合法性。
保持资金流向清晰：确保所有资金流动都有明确的记录和凭证，以便在需要时能够提供合规的税务文件。
