在程序源码中设置版权，通常有以下几种方法：
添加版权声明
在程序文件的头部加上版权声明，用来告知使用者该代码受版权保护，禁止未经授权的使用和修改。常见的版权声明格式如下：
```
// == //
Copyright （C） [年份] [作者]
All rights reserved.
filename: [文件名]
description: [文件描述]
http://houleixx.cnblogs.com
// == //
```
使用版权注册
计算机软件源代码不能单独登记著作权，需要和其他材料共同申请登记。根据《计算机软件著作权登记办法（2002）》第九条和第十条的规定，需要向中国版权保护中心提交以下材料：
填写的软件著作权登记申请表
软件的鉴别材料
相关的证明文件
添加许可证文件
在源码的根目录添加一个许可证文件，详细说明了使用者可以对源码进行的操作。常见的许可证包括GPL、MIT、Apache等。例如，在PHP源码中，可以在根目录添加一个名为`LICENSE`的文件，内容如下：
```
/*
* 许可证文件： MIT License
*
* Copyright （c） [年份] [作者]
*
* Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy
* of this software and associated documentation files （the "Software"）, to deal
* in the Software without restriction, including without limitation the rights
* to use, copy, modify, merge, publish, distribute, sublicense, and/or sell
* copies of the Software, and to permit persons to whom the Software is
* furnished to do so, subject to the following conditions:
*
* The above copyright notice and this permission notice shall be included in all
* copies or substantial portions of the Software.
*
* THE SOFTWARE IS PROVIDED "AS IS", WITHOUT WARRANTY OF ANY KIND, EXPRESS OR
* IMPLIED, INCLUDING BUT NOT LIMITED TO THE WARRANTIES OF MERCHANTABILITY,
* FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE AND NONINFRINGEMENT. IN NO EVENT SHALL THE
* AUTHORS OR COPYRIGHT HOLDERS BE LIABLE FOR ANY CLAIM, DAMAGES OR OTHER
* LIABILITY, WHETHER IN AN ACTION OF CONTRACT, TORT OR OTHERWISE, ARISING FROM,
* OUT OF OR IN CONNECTION WITH THE SOFTWARE OR THE USE OR OTHER DEALINGS IN THE
* SOFTWARE.
*/
```
使用加密保护
使用加密工具对源码进行加密，使其无法被轻易读取和修改。使用者需要获取解密密钥才能正常使用和修改源码。
签订授权协议
签订一个授权协议，详细规定了源码的使用范围、限制和授权方式等。
建议
明确版权声明：在程序文件的头部加上明确的版权声明，告知使用者该代码受版权保护。
注册著作权：虽然源代码不能单独登记著作权，但可以通过提交相关材料和申请来保护你的知识产权。
使用许可证：选择一个合适的开源许可证，并确保在源码中明确标注，以便使用者了解其权利和义务。
加密保护：对于敏感代码，可以考虑使用加密保护，但要注意密钥的安全管理。
授权协议：对于商业软件，签订详细的授权协议是保护知识产权的重要手段。
通过以上方法，可以有效地保护你的程序源码版权，防止未经授权的使用和修改。
