在微信小程序上卖烟的处罚主要包括以下几点：
行政处罚
如果商家没有持有烟草专卖零售许可证而擅自销售烟草制品，将会被工商行政管理部门责令停止经营烟草制品零售业务，没收违法所得，并处以罚款。
刑事处罚
非法经营烟草制品，情节严重的，将依据《刑法》第二百二十五条进行处罚。情节较轻者，将面临五年以下有期徒刑或拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重者，将受到五年以上有期徒刑的惩罚，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或没收财产。
其他处罚
如果商家将烟草制品卖给未成年人，除了上述处罚外，还可能面临警告、没收违法所得、五万元以下罚款等处罚。如果情节严重或拒不改正，可能会被责令停业整顿、吊销营业执照或相关许可证，并处以更高额的罚款。
综上所述，微信小程序上卖烟的行为如果被认定为非法经营，商家将面临严重的法律后果，包括罚款、没收违法所得，甚至刑事责任。因此，建议商家严格遵守相关法律法规，合法合规地进行经营活动。
