当发现执法程序违法时，可以采取以下步骤处理：
投诉 ：当事人可以向有关部门投诉执法人员的违法行为，要求其依法处理。责令改正
上级行政机关或有关部门：
对于违反法定程序作出的行政处罚，上级行政机关或有关部门可以责令原机关改正，并对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予行政处分。
作出行政许可决定的机关：对于违反法定程序作出的行政许可决定，作出行政许可决定的行政机关或其上级行政机关可以撤销行政许可。
行政复议 ：当事人可以申请行政复议，复议机关可以决定撤销、变更或者确认具体行政行为违法，并可以责令被申请人在一定期限内重新作出具体行政行为。行政诉讼：
当事人还可以通过行政诉讼途径，向法院提起诉讼，要求法院对执法程序违法的行为进行审查，并依法作出判决。
追究责任
执法过错责任追究：
公安机关人民警察在执行职务中，如因故意或过失造成执法过错，应遵循实事求是、有错必纠、过错与处罚相适应、教育与惩处相结合的原则，追究其责任。
内部监督：
行政机关内部应加强对执法行为的监督，建立健全执法监督机制，确保执法行为合法、公正、透明。
公开透明：
加强执法信息公开，接受社会监督，提高执法公信力。
通过以上步骤，可以有效处理执法程序违法行为，保障当事人的合法权益，维护法律的严肃性和公正性。
